Découvrez ce tutoriel complet sur l’utilisation du classificateur supervisé de CellProfiler Analyst pour un profilage phénotypique avancé sur cellules vivantes, exploitant spécifiquement les données issues de ChromaLIVE. Ce guide explique comment traiter les données issues d’expériences d’imagerie à haut contenu et de criblage à haut contenu sur cellules vivantes.

Le tutoriel détaille les approches d’analyse de données non supervisée (réduction de dimensionnalité, clustering avec StratoMineR™) et supervisée (entrainement du classificateur avec le module Classifier de CellProfiler Analyst). Il montre comment ChromaLIVE, un colorant polyvalent et non toxique, permet la détection de nombreux phénotypes cellulaires ainsi que la quantification d’événements cellulaires sensibles au temps, ce qui le rend idéal pour les applications d’essais de viabilité et de cytotoxicité en temps réel.

Les principales applications incluent la prédiction des mécanismes d’action des médicaments, l’évaluation des doses toxiques et la compréhension de la pharmacodynamie complexe à travers des essais cinétiques.
Le guide souligne la biocompatibilité sans précédent de ChromaLIVE, son protocole « mix-and-read » et son adaptation à l’incubation prolongée, y compris pour les modèles cellulaires 3D et l’imagerie 3D.
En fournissant des méthodes précises de profilage basé sur l’image en cellules vivantes, ce tutoriel permet aux chercheurs de révéler des phénotypes subtils et d’accélérer les efforts en découverte de médicaments.